Doktorand i medicinsk vetenskap: polymikrobiell urinvägsinfektionsmodell

About this job

Beskrivning av verksamheten Tjänsten är placerad vid laboratoriet Microbial Evolutionary Genetics (MEG), som leds av Johannes Cairns vid Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap, Medicinska fakulteten, Lunds universitet. Forskargruppen studerar mikrobiell evolution, antibiotikaresistens och mikrobiella interaktioner med hjälp av experimentell evolution, mikrobiell ekologi, bioinformatik och kvantitativ analys. Gruppen kombinerar experimentell mikrobiologi med dataanalys och samarbetar med nationella och internationella forskningsmiljöer. Doktoranden kommer att arbeta vid BMC i Lund i en liten tvärvetenskaplig forskningsmiljö med nära handledning och samarbete mellan experimentella och beräkningsinriktade forskare. Forskargruppens webbplats: https://johannescairns.github.io/meg-lab/. Projektbeskrivning Doktorandprojektet "Predicting eco-evolutionary dynamics in a polymicrobial urinary tract infection model" undersöker hur artinteraktioner påverkar antibiotikarespons, samhällssammansättning, biofilmsbildning och resistensutveckling i en definierad femartsmodell för urinvägsinfektioner. Projektet kombinerar longitudinella experiment i planktoniska och biofilmsystem med kvantitativ analys. Arbetet omfattar experimentell evolution, bakterieodling och fenotypning, antibiotika-dos-respons, sekvenseringsbaserad analys av samhällssammansättning samt statistisk modellering och bioinformatik. Projektet ingår i DDLS-miljön och genomförs i samarbete med forskare vid Lunds universitet och andra universitet. Arbetsuppgifter och ansvarsområden Huvudarbetsuppgifterna för en doktorand är att ägna sig åt sin forskarutbildning och därför kommer du både vara antagen som student och anställd vid Lunds universitet. Du kommer att: Planera och genomföra longitudinella experiment med definierade polymikrobiella UVI-modellsystem Etablera, underhålla och kvalitetssäkra mikrobiella odlingssystem, inklusive planktoniska och biofilmbaserade modeller Genomföra bakterieodling, provtagning, tillväxtkvantifiering, antibiotika-dos-respons och resistensfenotypning Sätta dig in i och använda universitetets system för kemikaliehantering, riskbedömning och elektronisk laboratoriedokumentation Arbeta i ett BSL-2-laboratorium och följa gällande biosäkerhetsrutiner, riskbedömningar och lokala säkerhetsföreskrifter Analysera experimentella data i R och/eller Python och bidra till statistisk modellering och visualisering Analysera sekvenseringsbaserade och, efter behov, andra omikdata Delta i experimentell planering, datahantering, manusförfattande, seminarier och vetenskapliga konferenser Genomföra obligatoriska kurser och andra moment inom forskarutbildningen Kvalifikationer Krav för antagningen är: Avlagd examen på avancerad nivå, fullgjorda kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper God förmåga av att tillgodogöra sig forskarutbildningen Minst 60 högskolepoäng inom ett ämnesområde relevant för medicinsk vetenskap Krav för anställningen är: Du har en masterexamen inom mikrobiologi, molekylärbiologi, bioteknik eller annat område relevant för projektet Du har dokumenterad praktisk erfarenhet av experimentellt mikrobiologiskt laboratoriearbete, inklusive bakterieodling, aseptisk teknik och kvantifiering av mikrobiell tillväxt Du har erfarenhet av att etablera och underhålla definierade mikrobiella odlingssystem och arbeta med syntetiska eller polymikrobiella bakteriesamhällen Du har dokumenterad erfarenhet av in vitro-modeller för polymikrobiella urinvägsinfektioner eller ett nära jämförbart infektionsrelevant polymikrobiellt modellsystem Du har erfarenhet av experiment som undersöker antibiotikarespons, mikrobiella interaktioner eller evolutionära förändringar i bakteriesamhällen Du har grundläggande erfarenhet av datahantering och analys i R och/eller Python Du har mycket goda kunskaper i engelska i tal och skrift Du är självgående och uthållig, har god skriftlig förmåga och kan arbeta strukturerat både självständigt och i samarbete med andra Meriterande för anställningen är: Du har erfarenhet av biofilmsystem, kateterrelaterade modeller eller andra infektionsrelevanta biofilmsystem Du har erfarenhet av experimentell evolution och/eller forskning om antimikrobiell resistens Du har erfarenhet av statistisk modellering, bioinformatik eller analys av sekvenseringsbaserade mikrobiella data Du har erfarenhet av arbete i forskningslaboratorium eller kliniskt mikrobiologiskt laboratorium Du har erfarenhet av kvantitativ mikrobiell fenotypning, exempelvis flödescytometri Stor vikt kommer att läggas vid hur den sökande genom sin erfa

Want to know if you're a fit? Check your CV against this role — free, in 30 seconds.

Similar jobs

• Amanuens inom digitalhistoria · Lunds Universitet
• Postdoktor i belysning, synergonomi och den visuella miljön · Lunds Universitet
• NANCYS STEAKHOUSE NOVA LUND SÖKER ERFAREN KÖKSANSVARIG · Ängelholms Hamnkrog AB
• Control System Software Engineer · Lunds Universitet
• Kvinnlig personlig assistent i Lund · Ideella Fören Smil
• Radio Baseband Tester · Ericsson AB